Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCIRG1Q13488 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCIRG1Q13488 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCIRG1Q13488 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCIRG1Q13488 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCIRG1Q13488 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCIRG1Q13488 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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