Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms