Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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TCOF1Q13428 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TCOF1Q13428 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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