Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SEMA3FQ13275 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms