Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CBX3Q13185 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CBX3Q13185 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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CBX3Q13185 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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CBX3Q13185 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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