Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHAF1AQ13111 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHAF1AQ13111 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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