Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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