Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SFSWAPQ12872 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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