Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SMARCB1Q12824 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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