Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RASGEF1BQ0VAM2 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RASGEF1BQ0VAM2 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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