Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CENPEQ02224 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CENPEQ02224 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms