Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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