Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PITX3O75364 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PITX3O75364 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PITX3O75364 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PITX3O75364 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PITX3O75364 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PITX3O75364 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms