Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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