Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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