Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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