Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ZNF548Q8NEK5 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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