Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
UBR3Q6ZT12 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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UBR3Q6ZT12 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
UBR3Q6ZT12 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
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