Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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