Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms