Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.6□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
LAMA3Q16787 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
LAMA3Q16787 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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