Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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DDB1Q16531 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDB1Q16531 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDB1Q16531 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDB1Q16531 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDB1Q16531 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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DDB1Q16531 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
DDB1Q16531 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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