Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC6Q16204 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms