Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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ZFHX3Q15911 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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ZFHX3Q15911 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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ZFHX3Q15911 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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ZFHX3Q15911 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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ZFHX3Q15911 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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ZFHX3Q15911 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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