Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HERC1Q15751 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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