Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TTF1Q15361 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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