Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRKQ15262 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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PTPRKQ15262 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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PTPRKQ15262 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRKQ15262 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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