Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
HERPUD1Q15011 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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