Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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COL9A2Q14055 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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COL9A2Q14055 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL9A2Q14055 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL9A2Q14055 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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COL9A2Q14055 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL9A2Q14055 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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