Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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PDE6HQ13956 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE6HQ13956 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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