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| RUNX3 | Q13761 | AC002456.1-201 | ENST00000415965 | 317 nt | TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPLP0P7-201 | ENST00000416050 | 667 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF885P-201 | ENST00000420174 | 1098 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005009.1-201 | ENST00000423979 | 269 nt | TSL 2 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL512656.1-201 | ENST00000427492 | 401 nt | TSL 2 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL391156.1-201 | ENST00000554965 | 554 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMG1P7-203 | ENST00000573141 | 619 nt | TSL 2 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL513324.1-201 | ENST00000575236 | 632 nt | TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM60BP-201 | ENST00000578364 | 658 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079089.3-201 | ENST00000603094 | 673 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083798.2-205 | ENST00000608015 | 575 nt | TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005046.1-201 | ENST00000608515 | 625 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10AB1P-201 | ENST00000609613 | 938 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104073.3-201 | ENST00000610942 | 955 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091304.9-201 | ENST00000612091 | 226 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589743.7-201 | ENST00000612637 | 233 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008250.2-201 | ENST00000615261 | 205 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6715A-201 | ENST00000615929 | 79 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138713.1-201 | ENST00000624026 | 2130 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MME-216 | ENST00000615825 | 5523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009812.4-201 | ENST00000569134 | 1805 nt | BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYTL2-230 | ENST00000634661 | 6672 nt | TSL 5 BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DMD-203 | ENST00000357033 | 13956 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.7 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GNAI3-201 | ENST00000369851 | 27174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158064.1-201 | ENST00000627044 | 2242 nt | TSL 4 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBPF20-202 | ENST00000392971 | 18450 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IKZF2-213 | ENST00000457361 | 9350 nt | TSL 5 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P9-201 | ENST00000505577 | 1534 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U8.3-201 | ENST00000363321 | 132 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-1-201 | ENST00000363925 | 141 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR19A-201 | ENST00000384878 | 82 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ31-201 | ENST00000390506 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P21-201 | ENST00000416634 | 589 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009963.1-201 | ENST00000417265 | 157 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157786.1-206 | ENST00000424422 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233728.2-201 | ENST00000425348 | 757 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL353777.1-201 | ENST00000425552 | 326 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P66-201 | ENST00000426566 | 466 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P4-201 | ENST00000427725 | 675 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL033539.1-201 | ENST00000427775 | 743 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004866.2-201 | ENST00000438285 | 481 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097347.1-201 | ENST00000438499 | 517 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL17P49-201 | ENST00000443728 | 411 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP004217.1-201 | ENST00000480579 | 346 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND1P3-201 | ENST00000484956 | 952 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LARP1BP2-201 | ENST00000486594 | 519 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C4orf33-204 | ENST00000502887 | 1126 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFB4P2-201 | ENST00000509515 | 391 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-46P-201 | ENST00000517038 | 113 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003467.2-201 | ENST00000520175 | 319 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZDHHC20P3-201 | ENST00000531576 | 336 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNRPGP16-201 | ENST00000533275 | 226 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL132819.1-201 | ENST00000555595 | 208 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TIMM9-208 | ENST00000556007 | 746 nt | TSL 3 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009063.1-201 | ENST00000563342 | 702 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356432.3-201 | ENST00000568952 | 465 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD53-201 | ENST00000579969 | 78 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3118-1-201 | ENST00000581787 | 76 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD84-203 | ENST00000584275 | 78 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099566.1-211 | ENST00000595188 | 737 nt | TSL 5 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136363.2-201 | ENST00000604173 | 851 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012443.1-201 | ENST00000605605 | 231 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX664608.1-201 | ENST00000610519 | 487 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLEU2_6.1-201 | ENST00000610536 | 112 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087241.4-201 | ENST00000612441 | 480 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008498.1-201 | ENST00000613012 | 531 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355810.1-201 | ENST00000614629 | 552 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WFDC11-203 | ENST00000618797 | 561 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009268.2-201 | ENST00000621925 | 457 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091953.2-201 | ENST00000623979 | 160 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MUC7-203 | ENST00000456088 | 2479 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC27A2-203 | ENST00000544960 | 2025 nt | TSL 2 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTC6-201 | ENST00000267368 | 1681 nt | TSL 5 BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01111-201 | ENST00000518732 | 1663 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.69 | □□□□□ -1.98 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093831.2-201 | ENST00000624393 | 3427 nt | BASIC | 2.68 | □□□□□ -1.98 | | |