Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RUNX3Q13761 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms