Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CUL3Q13618 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CUL3Q13618 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms