Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRR1Q13601 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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