Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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