Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms