Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PMS2P3Q13401 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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