Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SGCGQ13326 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms