Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRIM28Q13263 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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