Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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TRAF3Q13114 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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TRAF3Q13114 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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TRAF3Q13114 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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