Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPC1P35052 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPC1P35052 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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GPC1P35052 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GPC1P35052 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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