Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD10P28358 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD10P28358 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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