Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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PTPRAP18433 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPRAP18433 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRAP18433 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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