Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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LHX9Q9NQ69 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LHX9Q9NQ69 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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