Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TIMMDC1Q9NPL8 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms