Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GCSAMQ8N6F7 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms