Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms