Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms