Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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CTF1Q16619 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CTF1Q16619 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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