Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SGCAQ16586 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SGCAQ16586 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SGCAQ16586 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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