Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms